Вячеслав Яковлевич родился 21 сентября (04.10) 1873 года в г. Бежецке Тверской губернии в семье купца. С 1882 по 1888 гг. учился в Бежецком городском училище. С 1888 по 1893 гг. проходил обучение в Вышневолоцком училище кондукторов путей сообщения.
В 1894 г. выехал в Сибирь на службу по Округу водных путей сообщения. В 1900 г., успешно выдержав учебные испытания, получил право на самостоятельное производство инженерных работ и стал возглавлять экспедиции по техническому исследованию водных путей на Оби, Чарыше, Чулыме, Иртыше, Енисее, Лене. В 1909–1910 гг. провел первое научное исследование Бии от Телецкого озера до Бийска. В 1913–1914 гг. возглавлял геологическую экспедицию, работавшую по изысканию оптимального варианта Чуйского тракта.
В 1908 г. на страницах журнала «Сибирская жизнь» появилась символическая сказка «Кедр». В 1910–1912 гг. в «Сибирской жизни» вышли первые очерки писателя «На Лене», «Злосчастье», «В кают-компании», «Любителям красот природы» и рассказы «Однажды вечером», «Человек из города», «Собачья жизнь», «Бичевочка», «На севере». С 1912 г. произведения В. Я. Шишкова стали печататься в столичных журналах.
В 1915 г. В. Я. Шишков переехал из Томска в Петербург и поступил работать в Министерство путей сообщения. С 1917 г. целиком посвятил себя литературному творчеству; одна за другой появляются повести «Пейпус-озеро», «Ватага», «Странники», путевые очерки «Ржаная Русь», «Шутейные рассказы» и др.
В течение 14 лет (1918–1932 гг.) работал над романом «Угрюм-река» – семейной сагой, действие которой разворачивается в конце XIX – начале XX в. в Сибири вокруг семьи Громовых.
Во время Великой Отечественной войны, находясь в осажденном Ленинграде, а с апреля 1942 г. – в Москве публиковал очерки и рассказы на патриотические темы, продолжал работу над историческим романом «Емельян Пугачев», первый том которого вышел в 1938 г. Этот многолетний труд Шишкову завершить не удалось. Вторая и третья книги романа, удостоенного Сталинской премии первой степени в 1946 г., вышли уже после смерти писателя.
В. Я. Шишков был также награжден орденом «Знак Почета» (1939), орденом Ленина (1943), медалью «За оборону Ленинграда» (1944).
Очарованность Сибирью навсегда вошла в жизнь и творчество В. Я. Шишкова. Воспоминания и впечатления писателя о Сибири и Алтае транслировались во множество его произведений, среди которых повести «Алые сугробы», «Страшным кам», «Ватага», роман-эпопея «Угрюм-река», публицистика военных лет.
В 1973 г. имя В. Я. Шишкова к 100-летию со дня его рождения было присвоено Алтайской краевой универсальной научной библиотеке. В честь писателя, деятельность которого с 1909 по 1914 гг. была связана с исследованием Алтая, на здании библиотеки была установлена мемориальная доска.
С 2007 г. в Барнауле по инициативе Алтайской краевой библиотеки, Алтайской краевой краеведческой ассоциации и ученых края проводятся публичные Шишковские чтения.
Более подробную библиографию смотрите в Электронном каталоге АКУНБ.